เพื่อให้การส่งเสริมความเท่าเทียมระหว่างบุคคลและสร้างมหาวิทยาลัยมหิดลให้เป็นองค์กรที่ยึดมั่นในคุณค่าของศักดิ์ศรีความเป็นมนุษย์ ความเสมอภาคเท่าเทียม และการอยู่ร่วมกันด้วยความเคารพให้เกียรติในสังคม ที่ประกอบด้วยบุคคลที่มีความหลากหลายทางเพศในทุกมิติ ได้แก่ วิถีทางเพศ อัตลักษณ์ทางเพศ การแสดงออกทางเพศ และเพศสรีระ (sexual orientation, gender identity, gender expression, sex characteristics: SOGIESC) และไม่ยอมรับในการกระทำ อันเป็นการแบ่งแยก กีดกัน หรือจำกัดสิทธิประโยชน์ ไม่ว่าทางตรงหรือทางอ้อม โดยปราศจากความชอบธรรมเพราะเหตุที่บุคคลนั้นเป็นเพศชายหรือเพศหญิงหรือมีการแสดงออกที่แตกต่างจากเพศโดยกำเนิด เพื่อให้นักศึกษาสามารถพัฒนาศักยภาพของตนในฐานะมนุษย์ได้อย่างเต็มที่ และบรรลุเจตนารมณ์ดังกล่าว จึงมีนโยบายด้านกิจการนักศึกษา ว่าด้วยความเสมอภาค และส่งเสริมความเท่าเทียมระหว่างเพศ เพื่อให้สอดคล้องกับประกาศมหาวิทยาลัยมหิดล เรื่อง แนวปฏิบัติต่อนักศึกษาที่มีอัตลักษณ์ทางเพศ เพศสภาพหรือเพศสภาวะที่ไม่ตรงกับเพศกำเนิด พ.ศ. 2564 ดังรายละเอียดต่อไปนี้
กองกิจการนักศึกษาทบทวนและแก้ไขแนวปฏิบัติ ด้านการขอข้อมูลส่วนบุคคลของนักศึกษา กฎระเบียบ เรื่องการแต่งกาย ให้สอดคล้องกับคุณค่าของการเคารพในความเสมอภาคและ ส่งเสริมความเท่าเทียมระหว่างเพศ
กองกิจการนักศึกษาให้ความรู้ความเข้าใจแก่นักศึกษาในประเด็นความหลากหลายทางเพศ ความเสมอภาคและส่งเสริมความเท่าเทียมระหว่างเพศ รวมถึงแนวทางการอยู่ร่วมกันอย่างให้เกียรติ
กองกิจการนักศึกษาสนับสนุนกิจกรรมวิชาการ ชมรม และกิจกรรมของนักศึกษาในประเด็นความหลากหลายทางเพศความเสมอภาคและความเท่าเทียมระหว่างเพศ
กองกิจการนักศึกษาป้องกันมิให้มีกิจกรรมนักศึกษาที่แสดงออกถึงอคติทางเพศหรือการลดทอนคุณค่าของบุคคลทุกเพศ หรือมีการจำกัดเพศ ในการเข้าร่วม กิจกรรมวิชาการ ชมรมและกิจกรรมของนักศึกษา
กองกิจการนักศึกษามีหน้าที่รับเรื่องร้องเรียน หากมีนักศึกษาผู้ถูกเลือกปฏิบัติ ดูหมิ่น ดีตรา เกลียดชัง ไม่เคารพให้เกียรติด้วยเหตุ อันเกิดจากความหลากหลายทางเพศหรือกรณีเกิดความไม่เสมอภาค และความไม่เท่าเทียมระหว่างเพศ